R reshape2 melt()函数使用
原文链接 melt(data, id.vars, measure.vars, variable.name=“v…
使用perl脚本批量运行创建的shell脚本中的所有命令
parallel_run.pl 脚本代码 #!/usr/bin/perl -w use strict; use…
Convert Sequenza *segment.txt to GISTIC input
原文链接 Gistic was designed for SNP6 array data. I saw man…
ASCAT – CNV批量脚本
构建ascat_example.R，用于后续每个样本的模板 library(ASCAT) ascat.prep…
国内安装python包镜像加速
pip install 包名 -i http://pypi.douban.com/simple/ –trus…
Arriba绘制STAR-Fusion结果
Arriba提供的draw_fusions.R https://github.com/suhrig/arrib…
2023 CSCO Breast Cancer
STAR-Fusion输出结果转换为Circos输入文件
STAR-Fusion Github #!/usr/bin/env python3 import sys, o…
Manta 鉴定出的结构变异（SV）的vcf注释
manta生成的包含structural variants（SV）结构变异的注释vcf文件，通过染色体位置获得…