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作者: KevinZhou

Convert Sequenza *segment.txt to GISTIC input

Posted on 2023年 7月 12日 by KevinZhou

原文链接 Gistic was designed for SNP6 array data. I saw man…

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ASCAT – CNV批量脚本

Posted on 2023年 7月 11日2023年 7月 11日 by KevinZhou

构建ascat_example.R,用于后续每个样本的模板 library(ASCAT) ascat.prep…

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国内安装python包镜像加速

Posted on 2023年 7月 10日 by KevinZhou

pip install 包名 -i http://pypi.douban.com/simple/ –trus…

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Arriba绘制STAR-Fusion结果

Posted on 2023年 5月 29日2023年 5月 31日 by KevinZhou

Arriba提供的draw_fusions.R https://github.com/suhrig/arrib…

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2023 CSCO Breast Cancer

Posted on 2023年 5月 21日 by KevinZhou
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STAR-Fusion输出结果转换为Circos输入文件

Posted on 2023年 5月 19日2023年 5月 19日 by KevinZhou

STAR-Fusion Github #!/usr/bin/env python3 import sys, o…

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Manta 鉴定出的结构变异(SV)的vcf注释

Posted on 2023年 4月 28日2023年 7月 5日 by KevinZhou

manta生成的包含structural variants(SV)结构变异的注释vcf文件,通过染色体位置获得…

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Trim Galore 去除接头+质控流程

Posted on 2023年 4月 25日2023年 4月 25日 by KevinZhou

Trim Galore 去除接头+质控流程 软件使用简要说明 –quality:设定Phred qualit…

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生信分析流程汇总(自用未整理)

Posted on 2023年 3月 7日2024年 7月 12日 by KevinZhou

内容链接 scRNA-seq 单细胞分析流程 Exome-seq 外显子测序分析流程 RNA-seq 转录组测…

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2023 NCCN Breast English

Posted on 2023年 2月 17日2023年 3月 7日 by KevinZhou
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