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作者: KevinZhou

Ubantu 系统上 Docker 的安装

Posted on 2025年 12月 4日2025年 12月 4日 by KevinZhou

官网链接:https://docs.docker.com/engine/install/ubuntu/ 1. …

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使用RegDiffusion替代pySCENIC的 GRNBoost2 & GENIE3 进行基因调控网络分析(GRN)

Posted on 2025年 11月 21日 by KevinZhou

官网链接:https://tuftsbcb.github.io/RegDiffusion/downstream…

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Seurat转换为H5AD

Posted on 2025年 11月 6日2025年 11月 21日 by KevinZhou

参考链接:https://mp.weixin.qq.com/s/unwfRqWGjJYu9wXwaZwu7Q …

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Accessclient Mac中闪退问题

Posted on 2025年 10月 23日2025年 10月 24日 by KevinZhou

可能1 权限不足 chmod 777 /Applications/AccessClient.app 可能2 修…

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使用 Numbat 进行单细胞恶性细胞鉴定

Posted on 2025年 10月 15日2025年 10月 15日 by KevinZhou

Numbat官网: https://kharchenkolab.github.io/numbat/articl…

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使用CopyKAT进行单细胞恶性细胞鉴定

Posted on 2025年 10月 15日 by KevinZhou

github官网:https://github.com/navinlabcode/copykat copyka…

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Hotspot-单细胞聚类算法

Posted on 2025年 9月 10日 by KevinZhou

官网链接:https://github.com/YosefLab/Hotspot # 可本地运行的Hotspo…

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CONIPHER根据突变区分肿瘤亚克隆+ALPACA鉴定亚克隆的CNV改变

Posted on 2025年 8月 19日2025年 8月 19日 by KevinZhou

0. 官网: CONIPHER: https://github.com/McGranahanLab/CONIP…

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Pyclone-vi 输入文件处理

Posted on 2025年 7月 14日2025年 7月 14日 by KevinZhou

1. Call Somatic Mutations 首先通过Mutect2、Varscan2、Strelka2…

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使用 bam-readcount 统计 bam 文件在染色体指定位置的碱基数目

Posted on 2025年 7月 11日2025年 7月 14日 by KevinZhou

仅能统计SNP,无法统计INDEL,此软件会把INDEL打碎成单个碱基进行统计 1. 首先对bqsr处理好的b…

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