Skip to content

KevinZ的小窝

Menu
  • Home
  • Categories
Menu

月度归档: 2025 年 3 月

Germline mutation: GATK HaplotypeCaller

Posted on 2025年 3月 17日2025年 3月 21日 by KevinZhou

1. 前期处理 同somatic,处理成bqsr.bam 2. 按样本运行HaplotypeCaller生产g…

Read more

ASCAT(Allele-Specific Copy Number Analysis of Tumors) + breakclone

Posted on 2025年 3月 12日2025年 3月 12日 by KevinZhou

教程:https://github.com/VanLoo-lab/ascat/tree/master/Exam…

Read more

scarHRD

Posted on 2025年 3月 10日2025年 3月 10日 by KevinZhou

1. 进入虚拟环境并安装sequenza scarHRD需要sequenza的结果文件运行 conda act…

Read more

pyclone(老版)亚克隆鉴定

Posted on 2025年 3月 5日2025年 3月 5日 by KevinZhou

1.使用mutect按病人同时处理样本 gatk Mutect2 -R /data02/zhangmengme…

Read more
2025 年 3 月
一 二 三 四 五 六 日
 12
3456789
10111213141516
17181920212223
24252627282930
31  
« 2 月   4 月 »

俺家的猫~

胖达~

© 2025 KevinZ的小窝 |

粤ICP备2023017690号

|

粤公网安备 44010402003004号